上篇總論
第１章腸道微生物與消化系統疾病相關研究現狀與進展／003
第1節概述／003
第2節腸道微生物與系統疾病／003
第3節腸道共生菌的免疫調節功能／008
第4節孕烷X受體在調節細菌易位中的作用／015
第5節腸道菌群失調診治的現狀／023
第6節結語／025
第２章腸道微生物／028
第1節微生物與人體的相互作用／028
第2節腸道微生物的組成／032
第3節腸道微生物的生理／035
第4節腸道微生態平衡／039
第5節腸道微生物研究方法與方向／041
第３章腸道微生物與食物消化和營養吸收／046
第1節腸道微生物對攝入食物的代謝／046
第2節食物攝入對腸道微生物代謝的影響／047
第４章腸道微生物與藥物代謝／051
第1節腸道微生物與藥物代謝酶／051
第2節腸道微生物影響藥物代謝機制／054
第５章腸道微生物與免疫／058
第1節概述／058
第2節腸道微生物與先天免疫／061
第3節腸道微生物與適應免疫／062
第4節腸道微生物與肝臟自身免疫／065
第5節腸道微生物與腸黏膜屏障／067
第6節微生物來源的全身免疫應答的機制／068
第６章腸道細菌內毒素血癥／075
第1節腸道微環境／076
第2節腸道微生物群與敗血癥和膿毒血癥／080
第７章腸道微生物與炎癥／086
第1節腸道微生物群和免疫反應／086
第2節炎癥對腸道微生物群落結構的影響／091
第８章腸道微生物失調（生態失衡）／096
第1節微生物失調的概念與分類／096
第2節誘發因素／098
第3節臨床表現／101
第4節診斷／101
第5節防治／102
第９章中醫學對腸道微生物與消化系統疾病的研究與應用／109
第1節中醫對腸道微生態的認識／109
第2節中醫藥通過影響腸道微生物治療消化道疾病的臨床應用／112
第3節中醫藥通過影響腸道微生物治療消化道疾病的實驗研究／116
下篇各論
第１０章腸道微生物與炎癥性腸病／123
第1節炎癥性腸病的腸道菌群變化／123
第2節腸道菌群失調導致炎癥性腸病的機制／124
第3節調節腸道菌群在炎癥性腸病治療中的作用／130
第１１章腸道微生物與腸易激綜合征／133
第1節概述／133
第2節腸道菌群失調與腸易激綜合征／133
第3節治療／137
第１２章腸道微生物與功能性消化不良／141
第1節概述／141
第2節腸道微生物參與功能性消化不良的發病機制／142
第3節功能性消化不良的臨床表現和診斷標準／145
第4節功能性消化不良的治療／146
第１３章腸道微生物與功能性腹痛／149
第1節功能性腹痛/中樞介導的腹痛綜合征／149
第2節中樞介導的腹痛綜合征與腸易激綜合征／150
第3節功能性胃腸病及功能性腹痛綜合征發生機制及其與腸道微生物的關系／150
第4節診療／153
